航空总医院成立于1972年，隶属于世界五百强企业——中国航空工业集团有限公司，历经近50年发展，医院已成为集医疗、教学、科研、预防为一体的大型公立三级综合医院、航空工业医疗行业龙头医院、北京市北苑地区医疗中心、北京市医保A类定点医疗机构、联合国儿童基金会和国家卫计委联合授予的“爱婴医院”、中国医院协会授予的 “全国百姓放心示范医院”、北京市卫生局授予的“平安医院”、北京市首批社会医疗保险定点医疗机构、全国无烟医院、北京中医药大学和四川大学华西口腔医学院教学医院。

医院在2019年“国考”中位居A级，2020年度北京市三级医院医疗服务能力管理综合评价位列第17位。2017-2019年连续三年获“全国改善医疗服务行动示范医院”称号。